Report 34 - COVID-19 Infection Fatality Ratio Estimates from Seroprevalence

2020年10月29日–伦敦帝国理工学院

报告摘要34：COVID-19感染死亡率：来自血清阳性率的估计

感染死亡率（IFR）是估算2019年冠状病毒疾病（COVID-19）所来的负担的关键统计数据，并在当前的大流行中备受争议。先前的估计依赖于流行初期的数据，或者没有完全考虑血清学检测特征的不确定性以及从感染开始到血清转化，死亡和抗体减弱的延迟。在筛选了175项研究后，我们确定了10项有代表性的抗体调查，使用可以解决上述限制的建模框架，以更新IFR的估计。我们从血清调查中的区域差异推断出血清学检测的特异性，这对于在血清阳性率仍然较低的情况下正确估算累积感染比例至关重要。我们发现特定年龄的IFR遵循近似对数线性模式，死亡风险大约每八岁增加一倍。使用这些针对特定年龄的估计，我们估计，典型的年轻人人口比例较大的低收入国家/地区的总体IFR为0.23％（预测区间范围：0.14-0.42 95％的）。相反，在一个典型的高收入国家中，老年人的集中度较高，我们估计总体IFR为1.15％（预测区间范围：0.78-1.79 95％）。我们表明，考虑到血清逆转，抗体减弱导致血清学结果阴性，这在第一轮疫情爆发后几个月（例如意大利）进行的血清调查中，可以略微降低IFR。相反，在某些调查中，测试假阳性率的不确定性和低血清阳性率，可以使其他国家的粗病死率和IFR降低。IFR的无偏估计对于决策者制定关键的应对决策仍然至关重要。随着新疗法的引入，继续监测IFR仍非常重要。

可以在Github上的R Research Compendium中获得用于再现这些结果的代码：：`mrc-ide / reestimate_covidIFR_analysis`。

2020年10月29日–インペリアル・カレッジ・ロンドン

レポート34 概要：新型コロナウイルス感染症（COVID-19）の致死率：血清有病率からの推定

感染者致死率（IFR）は、COVID-19による負担を推定するための主要な統計値であり、現在のパンデミックを通して継続的に議論の対象となっているものです。以前の推定は、感染流行の初期のデータに依存していたか、血清学的検査の特徴の不確実性や、感染の発現から抗体陽転、死亡、抗体減少までの遅れを完全に説明するものではありませんでした。私たちは175の研究をスクリーニングした後、上記の制限に対処するモデリングフレームワークを使用して、IFRの最新の推定値を取得するために、10の代表的な抗体調査を特定しました。血清学的検査の特異性は、血清抗体調査での地域的差異から推測されました。これは、血清有病率がまだ低いときに感染した累積割合を正しく推定するために重要です。年齢別のIFRはほぼ対数線形のパターンに従い、死亡リスクは約8歳ごとに2倍になることがわかりました。この年齢別の推定値を使用すると、人口構造が若い人に偏っている典型的な低所得国の全体的なIFRは0.23％（0.14-0.42 95％予測区間範囲）と推定されます。対照的に、高齢者の集中度が高い典型的な高所得国の全体的なIFRは1.15％（0.78-1.79 95％予測区間範囲）と推定されます。 当レポートでは、抗体陰転（抗体が減少し、血清学的検査の結果が陰性となること）を考慮すると、イタリアなどで流行第一波の数か月後に実施された血清抗体調査のIFRがわずかに低くなる可能性があることを示します。対照的に、他国のIFRよりも見かけ上低い致死率は、検査の偽陽性率の不確実性や、一部調査での低い血清有病率によって説明がつきます。政策立案者が主要な対応の決定を通知するためには、引き続きIFRを偏りなく推定することが大切です。新しい治療法の導入とともに、IFRを引き続きモニタリングすることが重要となります。 

こうした結果を再現するためのコードは、研究要旨としてGithubから入手可能です：mrc-ide/reestimate_covidIFR_analysis

29 de octubre de 2020 — Imperial College London

Informe resumido 34: Tasa de letalidad de la infección de COVID-19. Estimaciones de prevalencia serológica
La tasa de letalidad de la infección (IFR, por sus siglas en inglés) es una estadística clave para estimar la carga de la enfermedad del coronavirus 2019 (COVID-19) y ha sido un continuo objeto de debate durante la pandemia actual. Las estimaciones previas se basaban en los datos iniciales de la epidemia, o no incluían la incertidumbre de las características de las pruebas serológicas y los retrasos desde la aparición de la infección hasta la seroconversión, el fallecimiento y la reducción de anticuerpos. Tras revisar 175 estudios, identificamos 10 estudios de anticuerpos representativos a partir de los cuales obtener estimaciones actualizadas de la IFR usando un marco modelo que aborde todas las limitaciones mencionadas anteriormente. Dedujimos la especificidad de la prueba serológica según la variación regional de las encuestas serológicas, lo que es fundamental para poder estimar correctamente la proporción acumulada infectada cuando la prevalencia serológica sigue siendo baja. Observamos que la IFR por edad sigue un patrón de regresión lineal, duplicándose el riesgo de fallecimiento aproximadamente cada ocho años de edad. A partir de estas estimaciones por edad, calculamos que la IFR general en un país de renta baja, con una estructura poblacional con una mayor proporción de individuos jóvenes, es de un 0,23 % (0,14-0,42 intervalo de predicción al 95 %). Por el contrario, en un país de renta alta con mayor concentración en la población de mayor edad estimamos que la IFR general es de un 1,15 % (0,78-1,79 intervalo de predicción al 95 %). Demostramos que, al tener en cuenta la serorreversión (reducción de anticuerpos que da lugar a un resultado serológico negativo), puede disminuir ligeramente la IFR en encuestas serológicas realizadas varios meses después de la primera ola, como observamos en Italia. En cambio, la incertidumbre sobre el porcentaje de pruebas con falsos positivos, combinada con la baja prevalencia serológica de algunas encuestas, pueden conciliar tasas de letalidad bruta aparentemente bajas con la IFR de otros países. Los cálculos objetivos de la IFR siguen siendo fundamentales para los responsables políticos a la hora de basar sus decisiones de respuesta clave. Será primordial que continuemos realizando un seguimiento de la IFR a medida que se introducen nuevos tratamientos. 

El código para reproducir estos resultados está disponible como un «R research compendium» en Github: mrc-ide/reestimate_covidIFR_analysis

29 octobre 2020 – Imperial College London

Rapport de synthèse 34 : Taux de létalité de l'infection à la COVID-19 : estimations à partir de la séroprévalence
Le taux de létalité de l'infection (IFR) est une statistique essentielle pour estimer les conséquences de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et a fait l’objet de nombreux débats tout au long de la pandémie actuelle. Les précédentes estimations s'appuyaient sur des données obtenues au début de la pandémie ou ne tenaient pas entièrement compte de l’incertitude des caractéristiques des tests sérologiques et des délais entre l'apparition de l’infection et la séroconversion, le décès et la baisse des anticorps. Après avoir examiné 175 études, nous avons identifié 10 études sur les anticorps représentatives qui ont permis d’obtenir des estimations actualisées de l’IFR à l’aide d’un cadre de modélisation tenant compte des limites énumérées ci-dessus. Nous en avons déduit les spécificités des tests sérologiques d’après la diversité régionale au sein des enquêtes sérologiques, ce qui est crucial pour estimer correctement la proportion cumulée de personnes infectées lorsque la séroprévalence demeure faible. Nous constatons que les IFR selon l’âge suivent un modèle quasiment log-linéaire, avec le risque de décès doublant environ tous les huit ans. À l'aide de ces estimations spécifiques à l’âge, nous estimons que l’IFR global dans un pays à faible revenu type, ayant une structure démographique déséquilibrée en faveur d’individus jeunes, s'élève à 0,23 % (0,14-0,42 %, intervalle de prévision de 95 %). En revanche, dans un pays à revenu élevé type, comptant une plus grande concentration de personnes âgées, nous estimons que l’IFR global s'élève à 1,15 % (0,78-1,79 %, intervalle de prévision de 95 %). Nous montrons comme explication de la séroréversion que la baisse des anticorps entraînant un résultat sérologique négatif, peut légèrement réduire l’IFR dans les enquêtes sérologiques menées plusieurs mois après la première vague de la pandémie, comme en Italie. En revanche, l’incertitude dans les pourcentages de faux positifs des tests associée à une faible séroprévalence dans certaines études peut apparemment rapprocher les taux de létalité bruts faibles de l’IFR dans d’autres pays. Les estimations non biaisées de l’IFR restent essentielles pour les décideurs politiques afin qu’ils puissent peser les décisions d'intervention clés. Il sera important de continuer à surveiller l’IFR à mesure que de nouveaux traitements seront lancés. 

Les codes permettant de reproduire ces résultats sont disponibles en tant que compendium de recherches sur Github : « mrc-ide/reestimate_covidIFR_analysis ».

29 أكتوبر 2020 - إمبريال كوليدج لندن

تقرير موجز 34: نسبة الوفيات الناجمة عن كوفيد-19 (COVID-19): تقديرات من الانتشار المصلي (عدد الأشخاص الذين ثبتت إصابتهم في الاختبارات (بفيروس كورونا المستجد) في وقت معين في بلد معين)
تُستخدم نسبة الوفيات الناجمة عن الإصابة (IFR) كعنصر رئيسي في تقدير الأضرار الناجمة عن مرض فيروس كورونا 2019 (COVID-19)، وقد كانت هذه النسبة محل جدال مستمر على مدى الجائحة الحالية. اعتمدت التقديرات السابقة على البيانات الصادرة في وقت مبكر من الجائحة، أو التي لم تأخذ في الحسبان بشكل كامل مسألة عدم اليقين في خصائص الاختبارات المصلية والتأخيرات من بداية العدوى وحتى حدوث التحول المصلي (مرحلة تتطور فيها الأجسام المضادة) والوفاة وتضاؤل ​​الأجسام المضادة. بعد فحص 175 دراسة، حددنا 10 استبيانات تمثيلية للأجسام المضادة للحصول على تقديرات محدثة لنسبة الوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس، باستخدام إطار عمل نمذجة يعالج القيود المذكورة أعلاه. وقد استنتجنا خصوصية الاختبارات المصلية من التباين الإقليمي داخل مناطق المسوحات المصلية، وهو أمر بالغ الأهمية في تقدير النسبة التراكمية المصابة بشكل صحيح، لا سيما وأن الانتشار المصلي ما يزال منخفضًا. وقد وجدنا أن نسبة الوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس تبعًا لأعمار المصابين تتبع نمطًا لوغاريتميًا خطيًا تقريبًا، حيث يتضاعف خطر الوفاة تقريبًا كل ثماني سنوات من العمر. واعتمادًا على هذه التقديرات الخاصة بالعمر، نقدر أن النسبة الإجمالية للوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس في بلد نموذجي منخفض الدخل، وذات تركيبة سكانية قوامها الأفراد الأصغر سنًا، يبلغ 0.23% (0.14-0.42 95% نطاق فترة التنبؤ). في المقابل، في بلد نموذجي مرتفع الدخل، مع وجود تركيز أكبر للأفراد المسنين، نقدر أن النسبة الإجمالية للوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس هي 1.15% (0.78-1.79 95% نطاق فترة التنبؤ). كما تبين لنا أن أخذ الانقلاب المصلي في الحسبان، وهو تضاؤل ​​الأجسام المضادة الذي يؤدي إلى نتيجة مصلية سلبية، يمكن أن يقلل بشكل طفيف من نسبة الوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس بين المسوحات المصلية التي أجريت بعد عدة أشهر من الموجة الأولى من الجائحة، كما هو الحال في إيطاليا. وعلى النقيض من ذلك، فإن عدم اليقين بشأن المعدلات الإيجابية الخاطئة للاختبار جنبًا إلى جنب مع معدل الانتشار المصلي المنخفض في بعض الاستطلاعات يمكن أن يوفق بين نسب الوفيات الكلية المنخفضة ونسب الوفيات الناجمة عن الفيروس في بلدان أخرى. ولا تزال التقديرات غير المتحيزة لنسب الوفيات الناجمة عن الإصابة بالفيروس حاسمة بالنسبة لواضعي السياسات في توجيه القرارات الرئيسية المتعلقة بتدابير الوقاية من المرض. لذا، سيكون من المهم الاستمرار في مراقبة نسب الوفيات الناجمة عن الفيروس مع تقديم علاجات جديدة.

جميع أكواد البرامج والبيانات والجداول التكميلية ونصوص التحليل والأرقام متوفرة في خلاصة بحثية وافية على
 mrc-ide/reestimate_covidIFR_analysis